جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "مایکوباکتریوم توبرکلوزیس" در نشریات گروه "پزشکی"
-
زمینه
از اهداف سازمان بهداشت جهانی، کاهش شیوع بیماری سل به کمتر از یک مورد در هر یک میلیون نفر تا سال 2050 می باشد. برای رسیدن به این هدف تشخیص سریع بیماری، ارائه درمان موثر و شناسایی سویه های مقاوم به دارو اهمیت بسیاری دارد. بر این اساس این مطالعه با هدف شناسایی مقاومت نسبت به اتامبوتول در بیماران مسلول مراجعه کننده به مرکز بهداشت اردبیل طراحی گردید.
روش کاردر این مطالعه مقطعی -توصیفی، بین سال های 96-99، 71 نمونه بالینی از بیماران مراجعه کننده به مرکز بهداشت اردبیل جمع آوری شد. نمونه ها ابتدا با روش میکروسکوپیک بررسی شده سپس با روش جوشاندن، DNA استخراج شد. به کمک پرایمرهای اختصاصی و تکنیک PCR حضور سویه های کمپلکس سلی و به دنبال آن مقاومت نسبت به اتامبوتول بررسی گردید.
یافته هااز 71 نمونه بالینی مورد بررسی 6 نمونه (8/45%) NTM بودند. از کل نمونه های مورد بررسی، 36 نمونه (50/7%) دارای موتاسیون ژن embB 306 بودند که از این تعداد 3 نمونه NTM بودند، کل مقاوم های NTM 50٪ بود). در بین ایزوله های مقاوم به اتامبوتول، در 6 نمونه، لود باکتری 1 مثبت بود (16/67%)، در 8 نمونه لود باکتری 2 مثبت بود (22/22%) و در بقیه همگی 3 مثبت یا بالاتر بودند (61/11%).
نتیجه گیریدر این مطالعه میزان فراوانی مقاومت نسبت به اتامبول 50/7% بود که درصد بالایی را نشان می دهد. همچنین این مطالعه نشان داد که روش MAS-PCR روشی سریع، ارزان و موثر برای شناسایی مقاومت نسبت به داروهای خط اول سل مانند اتامبوتول می باشد. به کمک این روش می توان همزمان مقاومت نسبت به بقیه داروهای خط اول را نیز بررسی کرد و با تشخیص سریع مقاومت های آنتی بیوتیکی و درمان موثرتر سویه های مقاوم از گسترش سویه های مقاوم در جامعه پیشگیری کرد.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, DNA, اتامبوتول, MAS-PCRBackgroundGlobal stop TB is a critical strategy which aims at reducing the incidence of tuberculosis to less than one case per one million people by 2050. To achieve this goal, it is necessary to establish a timely diagnosis of the disease, provide an effective treatment, and identify the drug-resistant strains. Therefore, this study aimed to identify the resistance to ethambutol in patients referred to Ardabil Health Center.
MethodsIn this descriptive cross-sectional study, 71 clinical samples were collected from the patients referred to Ardabil Health Center between 2017-2020. The samples were first examined adopting microscopic method, and then DNA was extracted using the boiling method. Specific primers and MAS-PCR technique were employed for identification of ethambutol resistance strains.
ResultsOut of 71 collected specimens, six samples were NTM (8.45%). Out of all the examined samples, 36 samples (50.7%) had embB306 gene mutation, of which three samples were NTM (total NTM resistance was 50%). Out of the samples identified as resistant to ethambutol, six samples had a low bacterial load as +1 (16.67%), eight samples had a moderate bacterial load as +2 (22.22%), and the rest had a high bacterial load as +3 (61.11%).
ConclusionIn sum, the frequency of resistance to ethambutol was 50.7%, which was higher than that reported by previous similar studies. Furthermore, it was determined that the MAS-PCR method was a fast, cheap, and reliable method for identifying resistance to the first-line tuberculosis drugs such as ethambutol. Therefore, this method may have facilitated evaluating the resistance to other first-line drugs at the same time and preventing the spread of resistant strains in the community through early detection of the antibiotic resistance.
Keywords: Mycobacterium Tuberculosis, DNA, Ethambutol, MAS-PCR -
سابقه و هدف
یکی از اهداف سلولی اولیه مایکوباکتریوم ها، ماکروفاژها هستند که باکتری استراتژی های مختلفی برای زنده ماندن و تکثیر در داخل فاگوزوم ها از جمله مانند ممانعت از اسیدیفیکاسیون فاگوزوم و ممانعت از ادغام فاگوزومی دارند. از طرفی اهمیت polarization و plasticity ماکروفاژها در مواجهه با عوامل عفونی، بین ماکروفاژهای M1 و M2 کاملا شناخته شده است. باتوجه به نقش دو ژن DUSP14 و RAP2A در فرایندهای ایمنی ذاتی، هدف از این مطالعه بررسی بیان این ژن ها در ماکروفاژهای افراد سالم آلوده شده با سویه های PB8، H37Rv و MTBRils است تا بتوان درک جامع تری از چگونگی عملکرد ایمنی ذاتی به دست آید.
مواد و روش هادر این مطالعه تجربی، پنج فرد سالم که نتیجه تست PPD آن ها منفی بوده است و سابقه ابتلا به بیماری سل را نداشتند انتخاب شدند. سپس PBMC ها با استفاده از گرادیانت فایکول جدا شده و با دستگاه Cell Counter تعداد سلول های موجود در رسوب شمارش گردید در ساخت محیط کشت به ازای 500 میلی لیتر محیط stem span، 2 میلی لیتر لیپید کلسترول و 5 میلی لیتر (10x) Pen/Strep به محیط اضافه شد و پس از 9 روز در محیط کشت غنی شده، تمایز و در نهایت بیان ژن های DUSP14 و RAP2A پس از مواجهه با سه سویه PB8، H37Rv و MTBRils طی 4، 18 و 48 ساعت پس از آلوده کردن سلول ها در محیط کشت، با روش ریل تایم بررسی گردید. بدین صورت که در ابتدا mRNA از محیط استخراج شد و از روی آن cDNA ساخته شد و PCR با مسترمیکس Takara صورت پذیرفت. جهت اندازه گیری میزان نسبی بیان تک تک ژن ها از روش -ΔΔ Ct2 استفاده شد. به همین منظور میزان بیان هر ژن در مقایسه با ژن رفرنس برای هر بیمار در سه مرحله بررسی شد. جهت بررسی آماری از نرم افزار SPSS نسخه 22 و GraphPad Prism نسخه 8 استفاده شد.
یافته هانتایج نشان داد که 4 ساعت پس از تیمار سلول ها با سویه H37Rv بیان ژن RAP2A نسبت به دو سویه دیگر بیان بیش تری داشته است، اگر چه افزایش بیان معنی دار نیست. هم چنین بیان ژن DUSP14 در 4 ساعت پس از آلوده شدن با همه سویه ها اگرچه افزایش معنی داری پیدا نکرد؛ اما در سویه PB8 افزایش بیان بیش تری نسبت به سویه های دیگر داشت. در این مطالعه نشان داده شد که بیان ژن RAP2A پس از گذشت 48 ساعت از آلودگی ماکروفاژها، سویه های H37Rv و MTBRils نسبت به PB8 و گروه کنترل کاهش نشان داد. بیان ژن DUSP14 نیز در همه زمان ها در گروه H37Rv و MTBRils نسبت به PB8 و گروه کنترل کاهش معنی داری دیده شد.
استنتاجکاهش بیان ژن RAP2A در دو سویه مایکوباکتریوم H37Rv و MTBRils نشان می دهد مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با کاهش فعالیت GTPase، سعی در اختلال در روند فاگوزوم و شیفت پاسخ ها به سمت ماکروفاژهای M2 دارد. مطالعات آتی بر روی نقش پلی مورفیسم های ژن های RAP2A و DUSP14 توصیه می گردد.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, بیان ژن, ایمنی ذاتی, ژن RAP2A, ژن DUSP14Background and purposeMacrophages are the primary cells that encounter this pathogen, and Mycobacterium tuberculosis (MT) has developed several strategies to survive within the macrophage cytoplasm. One of the primary cellular targets of Mycobacterium species are macrophages. These bacteria employ various strategies to survive and proliferate within phagosomes, including inhibiting phagosome acidification and preventing phagosome-lysosome fusion. On the other hand, the significance of macrophage polarization and plasticity in response to infectious agents is well-established, particularly in distinguishing between M1 and M2 macrophages. The DUSP14 gene regulates the Mitogen-Activated Protein Kinase (MAPK) pathway, while RAP2A is a member of the GTPase family. Considering the roles of the DUSP14 and RAP2A genes in innate immunity, the aim of this study is to investigate the expression of these genes in macrophages from healthy individuals infected with PB8, H37Rv, and MTBRils strains. This analysis seeks to provide a more comprehensive understanding of the mechanisms underlying innate immune function.
Materials and methodsPeripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were isolated from 40 cc of peripheral blood drawn from five healthy individuals with negative PPD test results, using Ficoll density gradient centrifugation. The extracted cells were counted using a cell counter and cultured in StemSpan medium supplemented with 2 ml of lipid cholesterol and 5 ml of Pen/Strep (10x) per 500 ml of culture medium. After nine days, the cells were infected with two MT strains: H37Rv, MTBRils, and PB8. Total RNA was extracted from the infected cells 8, 18, and 48 hours post-infection. cDNA synthesis was performed, and real-time PCR was conducted using Takara master mix to analyze RAP2A and DUSP14 gene expression. The relative fold changes in gene expression were calculated using the 2–∆∆Ct method, with statistical analyses performed using GraphPad Prism version 8 and SPSS version 20.
ResultsThe results showed that 4 hours after infection with the H37Rv strain, the expression of the RAP2A gene was higher than in groups infected with the other two strains, although the differences were not statistically significant. Additionally, while DUSP14 expression was not significantly increased 4 hours after infection with any of the three strains, its expression was higher in cultures infected with the PB8 strain. After 48 hours of MT infection, RAP2A gene expression decreased in macrophages infected with the H37Rv and MTBRils strains compared to the control and PB8-infected cells. Similarly, DUSP14 gene expression was significantly decreased in cells infected with the H37Rv and MTBRils strains compared to PB8-infected cells and controls.
ConclusionThe observed decrease in RAP2A gene expression in macrophages infected with the H37Rv and MTBRils strains is associated with reduced GTPase activity, suggesting that these strains may disrupt phagosome function, potentially shifting responses towards M2 macrophage polarization. Further studies investigating the role of RAP2A and DUSP14 gene polymorphisms in MT survival are recommended.
Keywords: Mycobacterium Tuberclosis, Gene Expression, Innate Immunity, RAP2A Gene, DUSP14 Gene -
باوجود کاهش میزان سل در سراسر جهان، موارد جدیدی از این بیماری همچنان در ایران گزارش می شود، اما سل پوستی غیر شایع و بخش کوچکی از موارد جدید را به خود اختصاص می دهد. مشابهت ظاهری زخم پوستی ایجادشده به دلیل سل پوستی با سایر بیماری های سیستمیک ازنظر بالینی چااش برانگیز است. سل جلدی به دو نوع تقسیم می شود: نوع واقعی که با تشخیص باسیل از پوست درگیر مشخص می شود و نوع توبرکلوئید که ناشی از واکنش حساسیت مفرط استمقاله حاضر موردی را بررسی می کند که در آن پس از نمونه برداری سوزنی تحت هدایت سی تی اسکن از ریه، سل پوستی در محل سوزن بیوپسی به شکل ندول زخمی پوست ظاهر شده است. این گزارش موردی بر اهمیت شرح حال و معاینه فیزیکی تاکید دارد و توجه پزشکان را به احتمال انتشار بیماری از طریق روش نمونه گیری سوزنی با هدایت سی تی اسکن جلب می کند.
کلید واژگان: سل جلدی, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, زخم نکروزان, درد پلورتیکDespite the reduction of tuberculosis globally, new cases of this disease continue to be reported in Iran, although skin tuberculosis is uncommon and constitutes a small portion of new cases. The presentation of skin ulcers caused by cutaneous tuberculosis can mimic other systemic diseases, leading to clinical uncertainty. Cutaneous tuberculosis is classified into two types: the true type, characterized by the presence of bacilli in the affected skin, and the tuberculoid type, resulting from an allergic reaction.This case report highlights a situation where a skin nodule, initially identified as cutaneous tuberculosis, was later confirmed through a lung biopsy guided by CT scan. It emphasizes the significance of medical history, physical examination, and considering the potential risk of disease spread during needle sampling procedures guided by CT scans.
Keywords: Cutaneous Tuberculosis, Mycobacterium Tuberculosis, Necrotizing Wound, Skin Ulcer, Pleuritic Pain -
مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی مشهد، سال شصت و هفتم شماره 2 (پیاپی 194، خرداد و تیر 1403)، صص 332 -340سابقه و هدف
سل معضلی قدیمی است که هم اکنون به عنوان چالشی جدید مطرح است. مطالعه حاضر با هدف بررسی تنوع ژنتیکی سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از بیماران مبتلا به سل در کرج، ایران انجام شد.
مواد و روش هاهفده جدایه مایکوباکتریوم توبرکلوزیس از سال 2012 تا 2013 جمع آوری شد و تحت آنالیز پلی مورفیسم طول قطعه محدود IS6110 (IS6110-RFLP) قرار گرفتند. از نظر جمعیت شناختی، 6 زن و 14 مرد دارای تابعیت ایرانی در این مطالعه وارد شدند.
نتایج16 نوع ژنتیکی مختلف پس از هضم آنزیمی و تجزیه و تحلیل RFLP به دست آمد. تعداد کپی IS6110 در هر ایزوله از 0 تا 12 متغیر بود. اکثر ایزوله ها (66%) دارای اعداد کپی بین 6 تا 12 بودند. هر ایزوله دارای 6.9 کپی از نشانگر IS6110 بود. 9 جدایه دارای 10 تا 12 نسخه از نشانگر IS6110، 5 ایزوله دارای 6 تا 10 نسخه، و 2 ایزوله دیگر دارای نسخه های کمتر از 6 بودند. هیچ نسخه ای از IS6110 در بین 4 ایزوله یافت نشد. هیچ رابطه ای بین جنسیت و تعداد کپی یافت نشد.
نتیجه گیریتنوع ژنتیکی بالای موجود در جدایه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ممکن است منابع مختلف عفونت و اهمیت ظهور مجدد سل را نشان دهد.با این حال، بررسی های بیشتر باید برای ارزیابی سایر جنبه های اپیدمیولوژیک مولکولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در ایران انجام شود.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, تنوع ژنتیکی, IS6110-RFLP, ایرانBackground and aimTuberculosis (TB) is an old issue that is presently measured as a significant challenge. The present survey was aimed to assess the genetic diversity of M. tuberculosis strains isolated from patients with TB in Karaj, Iran.
MethodsSeventeen M. tuberculosis isolates from 2012 to 2013 were collected and subjected to an IS6110 restriction fragment length polymorphism (IS6110-RFLP) analysis. Demographically, 6 females and 14 males who had Iranian citizenship were included in this study.
ResultsSixteen different genetic types were obtained after enzymatic digestion and RFL analysis. Copy numbers of IS6110 in each isolate ranged from 0 to 12. The majority of isolates (66%) harbored copy numbers between 6 and 12. Each isolates harbored 6.9 copies of the IS6110 marker. Nine isolates harbored 10 to 12 copies of the IS6110 marker, 5 isolates harbored 6 to 10 copies, and 2 others harbored copies less than 6. No copy of IS6110 was found among the 4 isolates. No relationship was found between gender and copy numbers.
ConclusionThe high genetic diversity found amongst the M. tuberculosis isolates maybe show different sources of infection and the importance of reemerging of the TB. However, further surveys should perform to assess other molecular epidemiologic aspects of M. tuberculosis in Iran.
Keywords: Mycobacterium Tuberculosis, Genetic Diversity, IS6110-RFLP, Iran -
سابقه و هدف
در دسامبر 2019 مجموعه ای از موارد پنومونی با منشا ناشناخته در ووهان چین گزارش شد که توسط سازمان بهداشت جهانی به عنوان COVID-19 نامگذاری شد. عوامل خطر ایجاد بیماری کووید-19 هنوز به خوبی شناخته شده نیست، اما شواهد نشان می دهد برخی عوامل از جمله بیماری های تنفسی مانند بیماری سل، از فاکتورهای خطر مهم در بیماری کووید-19 هستند. لازم به ذکر است، بیماری سل مانند SARS-COV-2، عمدتا از طریق تنفسی منتقل می شود و ریه ها را تحت تاثیر قرار می دهد. هم چنین برخی مطالعات نشان می دهد که عفونت همراه با مایکوباکتریوم توبرکولوزیس سبب ایجاد علایم پنومونی با سرعت بیش تر و شدیدتر در کووید-19 و عامل عمده مرگ به علت بیماری شدید ایجاد شده می باشد. با توجه به این که، بیماری کووید-19 یک پاندمی نوپدید بوده و عوامل خطر مرتبط با بروز و شدت آن هم چنان در حال بررسی است و با توجه به این که بیماری سل از بیماری های عفونی قابل درمان است که می تواند بر سایر بیماری های تنفسی اثر گذار باشد، این مطالعه با هدف بررسی فراوانی کووید-19 محتمل و قطعی در دو پیک اول و دوم پاندمی کرونا در بین مبتلایان با سابقه ابتلا به سل، انجام پذیرفت.
مواد و روش هااین مطالعه به صورت توصیفی- مقطعی، بوده است و جمعیت مورد مطالعه شامل بیماران با سابقه ابتلا به سل که تاریخ تشخیص آن ها در بازه زمانی 1394 الی 1399 بوده است. تعداد این نمونه ها برابر 1532 بوده است. روش نمونه گیری، سرشماری بوده است. زمان بررسی از نظر ابتلا به کووید-19 بعد از پیک اول و در طول و بعد از پیک دوم کرونا (از نیمه دوم اردیبهشت 1399 الی آبان 1399) بوده است. ابزار گردآوری اطلاعات شامل چک لیست حاوی متغیرهای دموگرافیک و علایم کلینیکی مرتبط با کووید-19 بوده است. روش گردآوری اطلاعات به صورت مصاحبه تلفنی و بررسی مستندات بود. جمع آوری اطلاعات توسط پرسشگران آموزش دیده انجام گرفت. بدین منظور، ابتدا به پرسشگران آموزش لازم خصوص نحوه تکمیل چک لیست ارائه شد. ورود داده در نرم افزار اکسل انجام و جهت آنالیز به نرم افزار SPSS ver.16 انتقال داده شد. توصیف متغیرها بر حسب تعداد، درصد، میانگین، انحراف معیار و میانه ارائه شده است. مقایسه بین متغیرهای گروه بندی شده با ازمون کای اسکوئر انجام گرفت.
یافته هادر این مطالعه، شیوع موارد کووید-19 محتمل و قطعی در بین بیماران با سابقه ابتلا به سل مورد بررسی، 5/5 درصد (85 نفر) و مورد مشکوک، محتمل و قطعی 6/15 درصد (239 نفر) گزارش شد. هم چنین ارتباطی بین گروه های سنی، جنسیت، محل سکونت، نوع بیماری سل، تاهل، دیابت، بیماری کلیوی و دیالیز، نقص ایمنی و بیماری کبدی با شیوع کووید-19 در بین بیماران با سابقه ابتلا به سل مورد بررسی مشاهده نشد. لازم به ذکر است، در این گروه از مبتلایان، بیماری قلبی، ریوی، سرطان و شیمی درمانی، فشارخون بالا و بیماری های مغز و اعصاب با شیوع کووید-19 مرتبط بود. هم چنین بیش ترین میزان فراوانی کووید-19 مشکوک، محتمل و قطعی در بین بیماران با سابقه سل تشخیص داده شده به ترتیب در سال 1399 با 5/38 درصد (25 از 65 مورد با سابقه بیماری سل)، سال 139 با 7/26 درصد (63 از 236 مورد با سابقه بیماری سل) و سال 1398 با 8/20 درصد (58 نفر از 279 مورد با سابقه سل) بوده است.
استنتاجبه نظر می رسد علی رغم محدودیت قرنطینه ای شدید در ابتدای پاندمی کووید-19 و احتمالا خود قرنطینه ای بالا در مبتلایان به سل به دلیل در معرض خطر بودن ازنظر سن بالا، ابتلا به بیماری های زمینه ای ابتلا مبتلایان به سل به کووید-19 نسبتا قابل ملاحظه بوده است.
کلید واژگان: کووید-19, بیماری سل, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, پاندمی, بیماری های تنفسیBackground and purposeIn December 2019, a series of pneumonia cases of unknown origin were reported in Wuhan, China, named by the World Health Organization as COVID-19. The risk factors for developing the disease of COVID-19 are still not well known, but evidence shows that some factors, including respiratory diseases such as tuberculosis, are important risk factors in the disease of COVID-19. It should be noted that tuberculosis, like SARS-COV-2, is mainly transmitted through breathing and affects the lungs. Also, some studies show that infection with Mycobacterium tuberculosis causes more rapid and severe pneumonia symptoms in COVID-19 and is the main cause of death due to severe disease. Considering that the disease of COVID-19 is a newly emerging pandemic and the risk factors related to its incidence and severity are still being investigated and considering that tuberculosis is a curable infectious disease that can affect other respiratory diseases. This study was conducted to investigate the probable and definite frequency of COVID-19 (COVID-19) in the first and second peaks of the coronavirus pandemic among patients with a history of tuberculosis.
Materials and methodsThis study was descriptive-cross-sectional and the study population included patients with a history of tuberculosis whose diagnosis date was between 2015 and 2020. The number of these samples was equal to 1532. The sampling method was census. The time of investigation in terms of contracting COVID-19 was after the first peak and during and after the second peak of Corona (from the second half of May 2019 to November 2019). The data collection tool included a checklist containing demographic variables and clinical symptoms related to COVID-19. The method of collecting information was in the form of telephone interviews and document review. Data collection was done by trained interviewers. For this purpose, the questioners were first given the necessary training on how to complete the checklist. Data entry was done in Excel software and transferred to SPSS V.16 software for analysis. The description of the variables is presented in terms of number, percentage, mean, standard deviation, and median. A chi-square test was conducted to compare the grouped variables.
ResultsIn this study, the prevalence of probable and definite cases of COVID-19 among patients with a history of tuberculosis was reported as 5.5% (85 people), and suspected, probable and definite cases were reported as 15.6% (239 people). Also, there was no correlation between age groups, gender, place of residence, type of tuberculosis, marriage, diabetes, kidney disease dialysis, immunodeficiency,, and liver disease with the prevalence of COVID-19 among patients with a history of tuberculosis. It should be noted that in this group of patients, heart disease, lung disease, cancer, chemotherapy, high blood pressure, and brain and nerve diseases were related to the spread of COVID-19. Also, the highest frequency of suspected, probable, and definite COVID among patients with a history of tuberculosis was diagnosed respectively in 2019 with 38.5% (25 out of 65 cases with a history of tuberculosis), in 2014 with 26.7% (63 out of 236 cases with a history of tuberculosis) and 20.8% (58 people out of 279 cases with a history of tuberculosis) in 2018.
ConclusionDue to the significant difference in the prevalence of Covid 19 in patients who have not received the flu vaccine, it is necessary to inject the flu vaccine in these patients. Advice to quit smoking in these patients should be a priority. Because no independent study on Covid disease was observed in patients with tuberculosis, further studies in this field are necessary.
Keywords: Covid-19, Tuberculosis, Mycobacterium Tuberculosis, Pandemic, Respiratory Diseases -
زمینه و هدف
پیرازینامید یکی از داروهای موثر بر درمان بیماری سل است. استفاده این دارو در رژیم درمانی باعث کوتاه شدن مدت زماندرمان سل میشود. وجود جهش در ژن pncA موجب از بین رفتن فعالیت پیرازینامیداز میشود که مهمترین مکانیسم مقاومت در ایزوله هایمایکوباکتریوم توبرکلوزیس است. بنابراین هدف از انجام این مطالعه بررسی مقاومت فنوتیپی و ژنوتیپی به آنتیبیوتیک پیرازینامید درایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به چند دارو) MDR (در استان خوزستان در بازه زمانی 1401 - 1395 میباشد.
روش بررسیاین مطالعه بر روی 40 ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در آزمایشگاه منطقهای سل اهواز انجام شد. تعیین حساسیتدارویی ایزوله ها به روش نسبی در آنتی بیوتیک پیرازینامید در ایزوله ها انجام گرفت. سپس تعیین فراوانی موتاسیونهای ژن pncA مرتبط بامقاومت پیرازینامید در ایزوله های MDR با استفاده از تعیین توالی انجام گرفت.
یافته هادر نتایج تست حساسیت دارویی نسبت به آنتیبیوتیک های ریفامپین و ایزونیازید تعداد 25 ایزوله که 16 سویه آن مقاوم به دو دارویایزونیازید وریفامپین (MDR-TB) و 9 ایزوله مقاوم تک دارویی) 8 ایزوله مقاوم به ریفامپین و 1 ایزوله مقاوم به ایزونیازید(به دست آمد. از 17نمونه ای که دارای ژن pncA و مقاوم به پیرازینامید بودند 13 ایزوله دارای موتاسیون در ژن pncA و 4 ایزوله فاقد هر گونه موتاسیون بودند.شایعترین موتاسیون، جهشهای غیر متشابه ، Non synonymous بود که در آن اسید آمینهی Val به Phe تبدیل شده است
نتیجه گیرینتایج این مطالعه نشان داد با توجه به فراوانی مقاومت به پیرازینامید در سویه های MDR ، تک مقاومتی و همچنین درصد بالایجهش در ژن pncA و شیوع کمتر جهش در ژنهای panD و rpsA ،که اطلاعات سریع و دقیقی در مورد حساسیت به پیراینامید برای ایزوله هایMDR-TB و تک مقاومتی فراهم میکند، بهترین روش تشخیص مقاومت به پیرازینامید توالی یابی و سکانس DNA کل pncA برای تایید مقاومتبه پیرازینامید به جای روش های معمول با پوشش نقاط داغ) hotspots (جهش یافته موثرتر است .
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, بیماری سل, پیرازینامید, مقاومت آنتی بیوتیکی, سل مقاوم به چند داروBackground and ObjectivesPyrazinamide is one of the effective drugs for treating tuberculosis. Inclusion of this drug in the treatment regimen shortens the duration of tuberculosis treatment. The mutation in pncA gene causes loss of pyrazinamidase activity, the most important resistance mechanism in Mycobacterium tuberculosis isolates. Therefore, the purpose of this study is to investigate the phenotypic and genotypic resistance to pyrazinamide antibiotic in multidrug-resistant (MDR) Mycobacterium tuberculosis isolates in Khuzestan province between 2017 and 2022.
Subjects and MethodsThis study was conducted on 40 isolates of Mycobacterium tuberculosis in Ahvaz TB Regional Laboratory. Drug sensitivity of the isolates was determined by the relative method in the antibiotic pyrazinamide in the isolates. Then, the frequency of pncA gene mutations related to pyrazinamide resistance in MDR isolates was determined using sequencing.
ResultsAccording to the results of the drug sensitivity to rifampin and isoniazid antibiotics, there were 25 isolates, of which 16 strains were resistant to two drugs, namely isoniazid and rifampin (MDR-TB), and 9 were single-drug resistant isolates (8 isolates resistant to rifampin and 1 isolate resistant to Isoniazid). Of the 17 samples that had the pncA gene and were resistant to pyrazinamide, 13 had mutations in the pncA gene while 4 did not have any mutations. The most common mutation was a non-synonymous mutation in which the amino acid Val had changed to Phe.
ConclusionAccording to the results of this study, there is a high frequency of resistance to pyrazinamide in MDR strains. Also, there is a high percentage of single-resistance mutations in the pncA gene, while there is lower prevalence of mutations in the panD and rpsA genes, which provide quick and accurate information about the sensitivity to pyrazinamide for MDR-TB and mono-resistant isolates. Therefore, the best method for detecting resistance to pyrazinamide is sequencing and whole pncA DNA sequence to confirm pyrazinamide resistance instead of the usual methods covering mutated hotspots.
Keywords: Mycobacterium Tuberculosis, Tuberculosis Disease, Pyrazinamide, Antibiotic Resistance, Multi-Drug Resistant Tuberculosis -
سابقه و هدف
پیدایش مقاومت های دارویی و ظهور سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به درمان، کنترل این بیماری را با چالش مواجه ساخته است. بنا به آمار سازمان بهداشت جهانی (WHO)، سالانه در سراسر جهان حدود 000,500 مورد ابتلای جدید سل مقاوم به دارو گزارش میشود. با توجه به اینکه مکانیسمهای مرتبط با بروز مقاومت های دارویی به درستی شناخته نشده است و تحقیق های مختلف نشاندهنده نتایج متفاوتی است، بر آن شدیم تا به بررسی جهشهای ژن thyA در ارتباط با مقاومت به داروی پارا- آمینوسالیسیلیک اسید (PAS) بپردازیم.
روش کاردر این مطالعه توصیفی- مقطعی، در مدت سه سال تعداد 255 نمونه مثبت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش استاندارد کشت و اسمیر جداسازی شد، سپس با انجام آزمون حساسیتسنجی دارویی 68 نمونه سل مقاوم به دارو انتخاب شد. برای بررسی جهش های ژن thyA، از روش PCR استاندارد استفاده شد و قطعه های حاصله توالییابی شدند. جهشهای منجر به تغییر کدون، با به کارگیری نرمافزارهای پیشبینی تغییرهای پروتئین آنالیز شدند. ارتباط جهشهای یافت شده با مقاومت به داروی PAS از لحاظ آماری توسط آزمون مربع کای مطالعه شد.
یافته هااز 255 نمونه مورد بررسی، 68 سویه (26/7درصد، فاصله اطمینان 21/3درصد) مقاوم به دارو تعیین شد. مجموعا 13 نمونه (19/1درصد) سویه مقاوم به PAS یافت شد که 5 سویه (38/4درصد) دارای جهش های نوکلئوتیدی مختلف در ژن thyA بودند. از لحاظ آماری ارتباط جهشهای مذکور با مقاومت آنتیبیوتیکی معنادار بود. به علاوه، نتایج آنالیز بیوانفورماتیک نشان داد که جهشهای یافتشده منجر به اختلال در عملکرد و ناپایداری در ساختار پروتئین حاصله میشوند.
نتیجه گیریطبق نتایج به دست آمده به نظر میرسد که جهش در ژن thyA با مقاومت به داروی PAS مرتبط است. همچنین یافتهها ارزش تشخیصی آنالیز قطعه های کوچک ژنومی و ابزارهای نوین بیوانفورماتیک را در شناسایی مکانیسمهای مقاومت دارویی نشان میدهد.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, مقاومت دارویی, جهش ژنتیکی, آنالیز بیوانفورماتیکBackground and AimThe emergence of drug resistance and treatment- renitent Mycobacterium tuberculosis has made controlling the disease a challenge. World Health Organization (WHO) estimates that approximately 500,000 new cases of tuberculosis occur annually. Considering that mechanisms involved in drug resistance are yet to be elucidated and results of the studies are not consistent, we decided to investigate the correlation between mutations in thyA gene and resistance to para- aminosalicylic acid (PAS).
MethodsIn this descriptive cross- sectional study, a total of 255 positive MTB specimens were isolated during a three- year period using standard microscopic and culture methods from which 68 Multidrug resistant (MDR) and extensively drug resistant (XDR) tuberculosis samples were selected through drug susceptibility testing. Then, to determine potential mutations in thyA gene, the fragment was amplified using conventional PCR and products were sequenced. Afterward, mutations which have been induced amino acid substitutions were evaluated with various protein prediction tools. Also, the correlation between mutations and drug resistance was statistically determined using chi-square test.
ResultsFrom 255 clinical TB samples, 68 (26.7%, CI 21.3%) MDR / or XDR-TB strains were isolated. In total, 13 (19.1%) were PAS- resistant and 5 (38.4%) of them had different nucleotide mutations in thyA gene. All of the mutations were statistically correlated with drug resistance. Moreover, the results of bioinformatics showed that identified mutations could lead to the structural and functional disruption of the protein.
ConclusionAccording to our results, mutations in thyA gene have appeared to be associated with resistance to PAS. Also, our findings have shed light on the potential of the analysis of short genomic regions and new computational tools in unraveling the molecular mechanisms of drug resistance.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, Drug resistance, thyA, Mutation, Bioinformatics -
شیوع عفونت سل نهفته بر حسب منطقه به طور چشمگیری متفاوت است. در حال حاضر یک چهارم جمعیت جهان به سل نهفته مبتلا هستند. جهت رسیدن به اهداف سازمان بهداشت جهانی جهت پایان سل در سراسر جهان تا سال 2030 تعداد افراد مبتلا به سل نهفته که به سمت سل فعال پیشرفت می کنند باید کاهش یابد. تست های رایج که جهت تشخیص سل نهفته کاربرد دارد بر اساس پاسخ ایمنی به آنتی ژن های اختصاصی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به دو نوع تست های پوستی و تست های مبتنی بر اندازه گیری اینترفرون گاما تقسیم بندی می شوند. با این وجود هر دو تست دارای حساسیت پایینی هستند و نمی توانند بین سل نهفته و سل فعال تمایز قائل شوند. بنابراین، تکنیک های مختلفی مانند تشخیص سیتوکین های جایگزین و استفاده از آنتی ژن های جدید برای افزایش دقت این آزمایش ها در حال مطالعه هستند. علاوه بر این، آنتی ژن های جدید را می توان برای نظارت بر پیشرفت سل فعال و پاسخ به درمان استفاده کرد. هدف از این مطالعه بررسی ابزارهای تشخیصی و شواهد موجود در مورد آنتی ژن های جدید مایکوباکتریوم توبرکلوزیس برای تشخیص سل نهفته و انتخاب آنتی ژن های امیدوارکننده برای تحقیقات آینده است.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, سل نهفته, تست های مبتنی بر رهاسازی اینترفرون گاما, مطالعه بالینی, تست های سرولوژیکLatent tuberculosis infection (LTBI) prevalence varies dramatically by region, with one-fourth of the world's population infected. The number of people with LTBI progressing to active tuberculosis illness (aTB) should be decreased to meet the WHO End TB Strategy objective of decreasing worldwide tuberculosis incidence by 2030. Current tuberculosis (TB) diagnostic methods are based on detecting an immune response to mycobacterial antigens injected into the skin or in vitro simulations in interferon-gamma release assays. Both tests have low sensitivity, which cannot distinguish between LTBI and aTB. Therefore, various techniques, such as alternate cytokine detection and employing novel antigens, are being studied to increase the accuracy of these tests. In addition, novel antigens can be used to monitor aTB progression and response to treatment. This review aims to assess current available diagnostic tools and evidence on novel Mycobacterium tuberculosis (Mtb) antigens for LTBI diagnosis and select the most promising antigens for future research.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, Latent Tuberculosis, Interferon-gamma Release Tests, Clinical Study, Serologic Tests -
سابقه و هدف
با توجه به اهمیت نگرانی از میزان مقاوم بودن RIF و با توجه به آمار سازمان جهانی بهداشت 399000-501000 گزارش کردند و با اطلاع نداشتن از این وضعیت در تهران این مورد گزارش شد. هدف از این مطالعه استفاده از روش GeneXpert MTB / RIF برای ارزیابی الگوهای مقاومت RIF در موارد سل ریوی خلط مثبت و تست مقاومت RIF در سویه های MTB موارد مشکوک بالینی MDR- TB در تهران بود.
روش کارتحقیق روش توصیفی انجام شده از اول فروردین 1400 تا 30 اسفند 1400 انجام شد. روش و تحقیق توصیفی روی 1000 نمونه بالینی افراد مشکوک به سل انجام شد. همه نمونه ها در مرکز سل استان مورد مطالعه برای آزمایش میکروسکوپی و کشت قرار گرفتند. آزمایش حساسیت دارویی به داروی خط اول ضد سل برای کشت MTB مثبت روی محیط کشت Löwenstein- Jensen (LJ) به روش نسبت انجام شد. تمام ایزوله های مقاوم و حساس به RIF توسط GeneXpert شناسایی شدند و شیوع میزان مقاومت در نمونه ها تعیین و میزان واقعی آن در جامعه برآورد شده است. سپس با استفاده از نرم افزار SPSS میزان مقاومت و عوامل موثر بر آن بررسی شدند.
یافته هابا توجه به این شیوع در این نمونه ها در این تحقیق از 440 نمونه مثبت تعداد سه نمونه مثبت یا 0/07 درصد مقاوم بوده است.
نتیجه گیریبه نظر می رسد مقاومت به ریفامپین مسیله خیلی بزرگی نیست و جای نگرانی نیست. در نتیجه، شیوع مقاومت دارویی در این منطقه مطالعه شده نسبتا پایین بود. پیشنهاد ما این است که مطالعه های بیشتری در مناطق مختلف این کشور انجام شود تا کارایی GeneXpert و اینکه آیا می تواند در ایران مفید و موثر باشد، ارزیابی شود.
کلید واژگان: مقاوم به ریفامپیسین, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, مقاوم به چند دارو, سنجش مایکو باکتریوم توبرکلوزیس, ریفامپیسین ژن اکسپرتBackground and AimMultidrug- resistant (MDR) tuberculosis (TB) is caused by a strain of Mycobacterium tuberculosis (MTB) that was at least resistant to isoniazid (INH) and rifampicin (RIF). World Health Organization reported 399,000-501,000 cases of RIF resistance and they reported this case without knowing about this situation in Tehran. So, it is an important concern.
MethodsDescriptive method and research was done on 1000 clinical samples of people suspected of tuberculosis. All the samples were studied in the TB center of the province for microscopic examination and culture. Using the ratio method, the drug sensitivity test to the first- line anti- tuberculosis drug was performed for positive MTB cultures on Löwenstein- Jensen (LJ) culture medium. All isolates resistant and sensitive to RIF were identified by GeneXpert and the prevalence of resistance in the samples was determined and its actual level in the community was estimated. Then, using SPSS software, the level of resistance and factors affecting it were checked.
ResultsAccording to theprevalence in these samples in this research, out of 440 positive samples, 3 positive samples, or 0.07% were resistant.
ConclusionIt seems that resistance to rifampin is not a big problem and is not a cause for concern. As a result, the prevalence of drug resistance in this study area was relatively low. Our suggestion is to conduct more studies in different regions of this country to evaluate the efficiency of GeneXpert and whether it can be useful and effective in Iran.
Keywords: Rifampicin Resistance, Mycobacterium Tuberculosis, Multi- Drug Resistance, GeneXpert MTB, RIF assay -
ظهور مقاومت دارویی در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس یک چالش بزرگ در درمان و کنترل سل است. علاوه بر این، مقاومت چند دارویی (MDR) و به طور گسترده تر، مقاومت دارویی (XDR) درمان با آنتی بیوتیک های رایج را مختل کرده است. بنابراین، یک داروی گیاهی حاوی قابلیت ضد میکروبی می تواند جایگزین مناسبی برای داروهای ضد سل باشد. در این مطالعه اثر گیاهان بومی در ایران به عنوان داروهای ضد مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بررسی شد. در این تجزیه و تحلیل سیستماتیک، کلمات کلیدی شامل گیاهان دارویی، عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، بیماری مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، MTB، اسانس ها و عصاره ها در Science Direct، Scopus، PubMed، Ovid، Cochrane، پایگاه اطلاعات علمی(SID)، ایران مدکس، ایران Doc، Magiran و Google Scholar جست و جو شد، که در آن مقالات منتشر شده از سال 2000 تا 2020 در نظر گرفته شده است. نتایج نشان داد که گیاهان بومی ایران مانند اسپند، لیمو مرکبات، Humulus lupulus، Capparis spinosa، Thymus vulgaris، Pulicaria gnaphalodes، Perovskia abrotanoides، Peganum harmala، Punica granatum Digitalis sp.، Rosa canina، Berberis vulgaris، Menthae. spp، Hypericum perforatum، Humulus lupulus، Trachyspermum copticum، Pelargonium graveolens، Levisticum officinale و Dracocephalum kotschyi همگی آنتی باکتری های موثری در برابر عفونت مایکوباکتریایی بین 0.5 میکروگرم تا 200 میلی گرم بودند. نشان داده شد که تیموس ولگاریس نسبت به سایر عوامل ضد باکتریایی مانند استرپتومایسین، سیکلوسرین ایزونیازید و اتامبوتول (0.5-40 میکروگرم در میلی لیتر) موثرتر است. داروهای گیاهی ممکن است یک گزینه درمانی موثر برای سل مقاوم به آنتی بیوتیک باشد. اثرات نامطلوب بالقوه و خواص ضد باکتریایی همراه با تداخلات هم افزایی احتمالی با سایر گیاهان و داروها نیازمند مطالعات بیشتر برای روشن شدن است.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, گیاهان دارویی عامیانه, گیاهان دارویی بومی, مرور سیستماتیکThe emergence of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis is a major challenge in tuberculosis treatment and control. In addition, multidrug resistance (MDR) and, more broadly, extensive drug resistance (XDR) have hampered treatment with common antibiotics. Thus, an herbal medicine containing antimicrobial capability can be a good alternative to antituberculosis drugs. In this study, we reviewed the effect of folk herbs in Iran as anti-Mycobacterium tuberculosis drugs. In this systematic analysis, keywords including medicinal plants, M. Tuberculosis infection, Tuberculosis disease, MTB, essential oils, and extracts were searched in Science Direct, Scopus, PubMed, Ovid, Cochrane, Scientific Information Database (SID), Iran Medex, Iran Doc, Magiran, and Google scholar where articles published from 2000 to 2020 were considered. The results indicated that Iranian native herbs such as Peganum harmala, Humulus lupulus, Capparis spinosa, Thymus vulgaris, Pulicaria gnaphalodes, Perovskia abrotanoides, Peganum harmala, Punica granatum, Digitalis sp., Citrus lemon, Rosa canina, Berberis vulgaris, Aloe vera, Mentha spp., Hypericum perforatum, Humulus lupulus, Trachyspermum copticum, Pelargonium graveolens, Levisticum officinale, and Dracocephalum kotschyi were all effective antibacterial against mycobacterial infection within 0.5 ug to 200 mg. Thymus vulgaris was shown to be the most effective than other antibacterial agents such as Streptomycin, Cycloserin Isoniazid, and Ethambutol (0.5-40 μg/mL). Herbal remedies may be an effective therapeutic option for antibiotic-resistant tuberculosis. Potential adverse effects and antibacterial properties, along with possible synergistic interactions with other plants and drugs, require further studies to clarify.
Keywords: Folk medicinal plants, Mycobacterium Tuberculosis, Native medicinal plants, Systematic review -
سابقه و هدف
سل از مشکلات اصلی سلامت جهانی با مرگ ومیر بالاست. ایجاد یک روش شناسایی سریع و ارزان به خصوص در کشورهای درحال توسعه، بسیار قابل توجه است. ازاین رو در این مطالعه، طراحی سیستم الایزای غیرمستقیم با استفاده از آنتی ژن های با وزن مولکولی پایین، جداشده از فیلتراسیون کشت مایکوباکتریوم توبرکوزیس سویه C، جهت شناسایی عفونت Mycobacterium tuberculosis Complex در انسان، مورد هدف قرار گرفت.
مواد و روش ها:
در این مطالعه، از پروتیین های ترشحی Mtb سویه C جداشده با Sephadex-G50 به عنوان آنتی ژن هدف، در طراحی سیستم الایزا استفاده شد. سپس نمونه سرم موارد بالینی دارای نتایج تست توبرکولین، کشت، اسمیر میکروسکوپی اسید فست و PCR، باهدف ردیابی آنتی بادی علیه این پروتیین های سبک وزن، توسط سیستم الایزای طراحی شده، موردبررسی قرار گرفتند.
یافته ها:
از میان فرکشن های پروتیینی به دست آمده از کروماتوگرافی، فرکشن دوم (F2) با غلظت تقریبی mg/ml7/0 و باندهای پروتیینی در محدوده 40-14 کیلودالتون در آنالیز SDS-PAGE (12.5%)، به عنوان آنتی ژن هدف در طراحی سیستم الایزا مورداستفاده قرار گرفت. سیستم الایزای طراحی شده، 78درصد حساسیت و 92درصد ویژگی در شناسایی افراد مبتلا به سل ریوی داشت.
استنتاجنتایج حاصل از سیستم الایزای غیرمستقیم بر پایه پروتیین های سبک وزن، با حساسیت و ویژگی به دست آمده در این مطالعه، این فرضیه را پشتیبانی می کند که آنتی ژن های با وزن مولکولی پایین موجود در فیلتراسیون کشت Mtb می توانند در تست الایزا به عنوان ابزار شناسایی مفید در شناسایی بیماران مبتلابه سل ریوی مورداستفاده قرار گیرند.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, پروتئین های سبک وزن, SDS-PAGE, الایزای غیرمستقیمBackground and purposeTuberculosis is one of the major global health problems with high mortality. Establishing a rapid and low-cost identification method is significant, especially in developing countries. In this study, we aimed to design an indirect ELISA system with low molecular weight antigens secreted by Mycobacterium tuberculosis strain C, for identification of Mycobacterium tuberculosis Complex infection in human.
Materials and methodsThe secretory proteins from culture filtrate of Mtb strain C extracted by Sephadex-G50 were used as target antigen in designing an indirect ELISA system. Then, human sera with tuberculin skin test, culture, acid-fast bacilli smear, and PCR test results were selected to detect human serum antibodies against these low molecular weight proteins.
ResultsDuring gel chromatography and SDS-PAGE (12.5%) analysis, the purified protein F2 fractions with approximately 0.7 mg/ml and molecular weights in the range of 14-40 kDa were used as the target antigen in designing the indirect ELISA system. The ELISA system designed by F2 showed 78% sensitivity and 92% specificity in identifying tuberculosis.
ConclusionThe ELISA results based on low molecular weight proteins, with the sensitivity and specificity achieved in this study, might support the hypothesis that the Mtb culture filtrate antigens could be used as a rapid and sensitive assay in ELISA test for detection of pulmonary TB.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, low-molecular weight proteins, SDS-PAGE, indirect ELISA -
مقدمه :
سل (Tuberculosis) TB، همچنان به عنوان یک مشکل جدی بهداشت عمومی در سراسر جهان است و سالانه میلیون ها مرگ و میر ایجاد می کند. تخمین زده می شود که یک سوم جمعیت جهان به سل نهفته آلوده باشند. سل مقاوم در برابر دارو یک تهدید بزرگ و در حال رشد جهانی تلقی می شود. هدف از این مطالعه، تعیین حساسیت دارویی جدایه های مایکوباکتریوم توبرکولوزیس از بیماران مراجعه کننده به آزمایشگاه رفرانس سل منطقه ای استان اصفهان (ملاهادی سبزواری) نسبت به داروهای خط اول ضد سل بود.
روش هادر این مطالعه، تعداد 438 جدایه ی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از تست های بیوشیمیایی و تاییدیه به واسطه ی تست مولکولی از بیماران مبتلا به سل ریوی مراجعه کننده به آزمایشگاه رفرانس منطقه ای سل استان اصفهان در طول سال های 1396-98 جدا گردید، تعداد 33 ایزوله ی مقاوم به دارو بررسی شد. تست حساسیت دارویی نسبت به داروهای خط اول درمان به روش پروپورشن انجام گرفت و از سویه ی استاندارد H37Rv مایکوباکتریوم توبرکلوزیس که حساس به تمامی داروها می باشد، به عنوان کنترل استفاده شد.
یافته هااز تعداد 438 جدایه، 20 جدایه (37/7 درصد) حساس و 33 جدایه (62/3 درصد) مقاوم به خط اول درمان به روش فنوتیپی بودند که به ترتیب ایزونیازید 22 جدایه (66/7 درصد)، ریفامپیسین 18 جدایه (54/5 درصد)، اتامبوتول 4 جدایه (12/1 درصد) و پیرازین آمید 5 جدایه (15/2 درصد) بود، همچنین 10 جدایه (30/3 درصد) سل مقاوم به چند دارو بودند.
نتیجه گیریالگوی مقاومت دارویی در سل در هر منطقه ی جغرافیایی متفاوت است و در منطقه ی اصفهان به دلیل مقاومت رو به افزایش سل، تحقیقات بیشتری برای تعیین مقاومت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس نیاز است.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, مقاومت دارویی, ایزونیازید, ریفامپین, اتامبوتول و پیرازین آمیدBackgroundTuberculosis (TB) remains a serious public health problem worldwide, causing millions of deaths annually. It is estimated that one-third of the world population is infected with latent TB. Drug-resistant TB is considered a major and growing global threat. In this study, we aimed to indicate the drug-susceptibility of Mycobacterium tuberculosis isolates from patients, presented to Mollahadi Sabzevari Tuberculosis Center in Isfahan, Iran to the first-line drugs.
MethodsIn this study, Mycobacterium tuberculosis was isolated from 438 patients with pulmonary tuberculosis referred to the Regional Reference Laboratory of tuberculosis in Isfahan province during 2017-2019, 33 resistant isolates were studied. Drug susceptibility testing to first-line drugs was performed by proportion method, and the H37Rv reference strain sensitive to all drugs was used for quality control.
FindingsOut of 438 isolates, 20 isolates (37.7%) were drug-sensitive and 33 isolates (62.3%) were resistant to the first-line drug by phenotypic method, which was isoniazid (INH) 22 isolates (66.7%), rifampin (RIF) 18 isolates (54.5%), ethambutol (EMB) 4 isolates (12.1%) and pyrazinamide (PZA) 5 isolates (15.2%) respectively. Also, 10 isolates (30.3%) were multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB).
ConclusionThe pattern of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis is different in each region and in the Isfahan region due to the increasing drug resistance of tuberculosis. Further research is needed to determine the drug resistance of Mycobacterium tuberculosis.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, Drug resistance, Isoniazid, Rifampin, Ethambutol, Pyrazinamide -
سابقه و هدف
بیماری سل به عنوان تهدیدی برای سلامت بهداشت جهانی مطرح است. بررسی اپیدمیولوژی بیماری سل می تواند در شناسایی منبع عفونت، سویه های غالب در حال گردش و دستیابی به مسیرهای انتقال در دنیا، نقش موثری داشته باشد. هدف از این مطالعه، تعیین ژنوتایپ سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مراجعه کننده به انستیتو پاستور ایران در سال های 1397-1396 بود.
روش بررسیدر این مطالعه، 50 سویه تایید شده از نظر عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مورد بررسی قرار گرفتند. سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بعد از شناسایی و تعیین الگوی حساسیت دارویی با روش MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit Variable Number Tandem Repeat)، تعیین ژنوتایپ شدند.
یافته هاژنوتایپ های شناسایی شده CAS/Delhi (42%)، Haarlem (%24)، NEW-1 (%10)، LAM (%8)، Beijing (%8)،Cameroon (%4)، EAI (%2) و S (%2) تعیین شدند و سه کلونال کمپلکس و 44 سویه singleton شناسایی شدند. در سویه های مقاوم،ژنوتایپ Beijing، ژنوتایپ غالب بود. هم چنین لوکوس های QUB26 و QUB4156 دارای بالاترین قدرت افتراق و تنوع آللی بودند.
نتیجه گیری:
ژنوتایپ CAS/Delhi وBeijing به ترتیب به عنوان ژنوتایپ های غالب در سویه های حساس به دارو و MDR معرفی شدند.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, MIRU-VNTR, ژنوتایپMedical Science Journal of Islamic Azad Univesity Tehran Medical Branch, Volume:31 Issue: 3, 2021, PP 328 -337BackgroundTuberculosis is a threat to public health. The epidemiology of tuberculosis can be effective in identifying the source of infection, the dominant circulating strains and achieving transmission pathways in the world. The aim of this study was to determine the genotype of Mycobacterium tuberculosis (M. tb) strains in patients referred to Pasteur Institute of Iran between 2018 and 2019.
Materials and methodsIn this study, 50 confirmed M. tb strains were evaluated. After M. tb strains identification and determining the drug susceptibility test, all strains were genotyped by MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit Variable Number Tandem Repeat) method.
ResultsThe most frequent genotype in all strains was CAS/Delhi (42%), followed by Haarlem (24%), NEW-1 (10%), LAM (8%), Beijing (8%), Cameroon (4%), EAI (% 2) and S (2%). Three clonal complexes and 44 singleton isolates were identified. Beijing genotype was the common genotype in MDR-TB strains. Also, QUB26 and QUB4156 loci had shown the highest of discriminative and allelic diversity.
ConclusionCAS/Delhi and Beijing genotypes were introduced as the dominant genotypes in drug sensitive and MDR strains, respectively.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, MIRU-VNTR, Genotype -
زمینه
یکی از اختلالات متابولیک که اثر منفی بر زندگی انسان دارد دیابت است. ابتلای هم زمان دیابت و بیماری سل می تواند موجب اختلال در درمان و کنترل بیماری سل شود.
هدفاین مطالعه برای بررسی شیوع سل در بیماران دیابتی شهرستان کردکوی در سال 1396 انجام شده است.
مواد و روش هادر این مطالعه 925 داوطلب از بیماران دیابتی شهرستان کردکوی وارد مطالعه شدند. مطالعه با استفاده از چک لیست انجام شد و شامل مشخصات جمعیت شناختی و سوابق پزشکی بود. معاینات داوطلبان انجام شد و برای تشخیص عفونت سل از تست پوستی توبرکولین و برای تشخیص بیماری سل از آزمایش اسمیر خلط و رادیوگرافی قفسه سینه استفاده شد. در صورت لزوم نیز افراد به متخصص عفونی ارجاع شدند.
یافته هادر این مطالعه 716 داوطلب زن بودند. میانگین سنی داوطلبان 11/1±58/4 و مدت ابتلا به بیماری دیابت 5/47±8/39 سال بود. از میان همه داوطلبان 62 داوطلب رادیوگرافی قفسه سینه غیرطبیعی، چهارده داوطلب سرفه بیش از دو هفته، یک داوطلب تب، دو داوطلب تعریق شبانه، یازده داوطلب خلط و 152 داوطلب تست پوستی توبرکولین مثبت داشتند. ده داوطلب دارای سابقه ابتلا به سل بودند و یک داوطلب دارای بیماری سل فعال شناخته شد.
نتیجه گیریشیوع سل در بیماران دیابتی شصت برابر شیوع هم زمان و بروز این بیماری شش برابر جمعیت عمومی به دست آمد.
کلید واژگان: شیوع, سل, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, دیابتBackgroundTuberculosis (TB) is a chronic bacterial infection. Simultaneous onset of diabetes and TB can interfere with the treatment and control of TB.
ObjectiveThis study aims to investigate the prevalence of TB in diabetic patients living in rural areas of northern Iran.
Materials and MethodsParticipants were 925 diabetic patients living in rural areas of Kordkuy County, Golestan, Iran. Data were collected using a checklist surveying demographic characteristics and medical records of patients. To diagnose TB, they underwent a TB skin test, sputum smear test, chest radiography, and referring to an infectious diseases specialist, if needed.
ResultsSeven hundred sixteen of participants were female. The mean age of participants and their mean duration of diabetes were 58.4±11.1 and 8.39±5.47 years, respectively. Results of test showed that 62 patients had abnormal chest x-ray; 14 had coughing more than two weeks; 1 had fever; 2 had night sweats; 11 had sputum; 152 had positive TB skin test result; 10 had a history of previous TB; and 1 had active TB.
ConclusionThe prevalence and incidence of TB in diabetic patients is 60 and 6 times higher than in general population, respectively.
Keywords: Prevalence, Tuberculosis, Mycobacterium tuberculosis, Diabetes -
زمینه و هدف
شناسایی سریع بیمارانی که دارای ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس هستند امری ضروری برای درمان این بیماران است . بیماری سل یکی از خطرناکترین بیماری های عفونی حال حاضر جهان است و گسترش آن بویژه در کشورهای در حال توسعه روبه افزایش است . شناسایی سریع بیمارانی که دارای ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس هستند امری ضروری برای درمان این بیماری است .هدف از این مطالعه، بررسی ژن DosT در بیماران مبتلا به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس میباشد.
روش بررسیحضور ژن DosT در بیماران مبتلا به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با PCR مشخص شد و با روش های آماری فراوانی حضور این ژن در نمونه های حساس و مقاوم مایکوباکتریوم توبرکلوزیس تجزیه و تحلیل شد.
یافته هاژن DosT در تمامی بیماران مبتلا به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با تکنیک PCR شناسایی شد (bp 219). فراوانی ژن DosT در ایزوله های بیماران مبتلا به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس تعیین شد (% 3/94) . درصد حضور ژن DosT دربیماران مبتلا به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس و مقاوم مشخص شد (در بیماران مبتلا به توبرکلوزیس حساس % 8/78 و مقاوم 2/21 %)
نتیجه گیریحضور ژن DosT تقریبا درتمامی بیماران مبتلا به مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مشخص شد و نشان داده شد این ژن در ایزوله های حساس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس فراوانی بیشتری را دارد.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, سل, ژن, DosT, PCRNafas Journal, Volume:7 Issue: 2, 2021, PP 22 -29Mycobacterium tuberculosis is a pathogen that can cause tuberculosis in the host. Although Mycobacterium tuberculosis is the oldest known bacterium in humans, it is still a deadly disease worldwide. Mycobacterium tuberculosis can survive in the human body for decades without any symptoms. However, it may be activated in people with defective immune systems or people with diseases such as diabetes, AIDS or malnutrition, leading to tuberculosis. The aim of this study was to evaluate the dosT gene in patients with Mycobacterium tuberculosis The presence of dosT gene in patients with Mycobacterium tuberculosis was determined by PCR and the presence of this gene in susceptible and resistant samples of Mycobacterium tuberculosis was analyzed by many statistical methods. The dosT gene was detected in all patients with E. coli by PCR (219 bp). The frequency of dosT gene in isolates of patients with Mycobacterium tuberculosis was determined (94.3%). The percentage of dosT gene presence in patients with susceptible and resistant Mycobacterium tuberculosis was determined (78.8% and 21.2% in patients with recessive tuberculosis) The presence of dosT gene was detected in almost all patients with Mycobacterium tuberculosis and it was shown that this gene is more common in susceptible isolates of Mycobacterium tuberculosis.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, tuberculosis, dosT gene, PCR -
مقدمه
سل یکی از بیماری های عفونی است که از دیر باز سلامت بشر را تهدید می کند. هدف از این مطالعه بررسی چگونگی گردش مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در شهرستان دلفان برای نیل به مراقبت بهتر از بیماری است.
مواد و روش هااین مطالعه، مطالعه ای توصیفی- تحلیلی است که در شهرستان دلفان در غرب ایران انجام شد. اطلاعات مطالعه از پرونده تمام بیمارانی که از سال 1389 تا سال 1398 به مراکز بهداشت شهرستان دلفان مراجعه کرده بودند، به روش سرشماری، جمع آوری شد. پس از جمع آوری داده ها آنها را وارد نرم افزار SPSS 23 کردیم و برای تجزیه و تحلیل داده ها از جداول فراوانی وآزمون های تی مستقل و کای دو استفاده شد.
یافته هامیانگین سنی بیماران 34/22 ± 56/47 بود. از مجموع 125 پرونده حاضر، 76 نفر سل ریوی اسمیر مثبت، 18 نفر اسمیر منفی و 31 نفر سل خارج ریوی داشتند. 80 درصد افراد مبتلا بی سواد و دارای تحصیلات ابتدایی بودند. به طور متوسط فاصله بین بروز علایم تا تشخیص بیماری در همه اشکال سل، تقریبا 97 روز بود. بین نوع سل و محل اقامت (006/0 p≤)، سن(004/0 p≤)و تاخیر در تشخیص(022/0 p≤) رابطه آماری مشاهده شد.
بحث و نتیجه گیریدر مطالعه حاضر بیشترین درصد مبتلایان بی سواد بودند لذا آموزش و اقدامات پیشگیرانه برای کنترل بیماری سل به این قشر آسیب پذیر توصیه می شود. هم چنین با توجه به زیاد بودن فاصله بروز بیماری تا تشخیص ضروری است که برنامه مراقبت سل در شهرستان با جدیت بیشتری دنبال شود تا این فاصله کوتاه تر شود.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, سل, لرستان, دلفانYafteh, Volume:22 Issue: 4, 2021, PP 14 -24BackgroundTuberculosis is one of the infectious diseases that have long threat human health. The purpose of this study was to evaluate the circulation of Mycobacterium tuberculosis in Delfan city to achieve better care of the disease.
Materials and MethodsThis is a descriptive-analytical study conducted in Delfan. The study data were collected from the records of all patients referred to health centers of Delfan from 2011 to 2020 using census method. SPSS 23 software was used for data collection. Frequency tables and Chi-square tests were used to analyze the data.
ResultsThe mean age of the patients was 47.56 ± 22.34. from a total of 125 cases present, 76 were positive pulmonary smear tuberculosis, 18 were negative smear and 31 were extra-pulmonary tuberculosis. Eighty percent of patients have illiteracy and primary education. On average, the interval between the onset of symptoms and the diagnosis of the disease in all forms of tuberculosis was approximately 97 days. Also, a statistical relationship was observed between the type of tuberculosis and the place of residence (p≤. / 006), age (p≤. / 004) and delay in diagnosis (p≤ / 022).
ConclusionIn the present study, most of the patients were illiterate, so training and preventive measures to control tuberculosis are recommended for this group. Also, due to the large distance between the disease and the diagnosis, it is necessary to follow the tuberculosis care program in this city more seriously in order to shorten this distance
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, tuberculosis, Lorestan, Delfan -
زمینه و هدف
ظهور مقاومت دارویی در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس و به ویژه پیدایش سویه های مقاوم به دارو مشکلاتی را برای درمان و کنترل شیوع سل در سرتاسر جهان به وجود آورده است. این مطالعه به منظور ارزیابی تغییرات الگوی متیلاسیون ژن N-استیل ترانسفراز (N-acetyltransferase: NAT) در بیماران بی پاسخ به خط اول درمان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس انجام شد.
روش بررسیاین مطالعه توصیفی - تحلیلی روی 200 بیمار مبتلا به سل انجام شد. بعد از تهیه نمونه خونی از روش نمک اشباع برای استخراج DNA استفاده گردید. سپس برای تعیین کمیت و کیفیت DNA از دو روش اسپکتروفوتومتری و الکتروفورز بر روی ژل اگارز استفاده شد. بررسی الگوی متیلاسیون ژن NAT1 به روش HRM انجام شد.
یافته ها:
34 بیمار به خط اول درمان مقاوم بودند. 18 بیمار دارای الگوی هایپرمتیلاسیون، 12 بیمار الگوی غیرمتیله و 4 بیمار الگوی هایپومتیله را نشان دادند. 166 بیمار به خط اول درمان مقاوم نبودند که از این میان 23 بیمار در گروه هایپرمتیله، 120 بیمار در گروه غیرمتیله و 23 نفر در ردیف هایپومتیله قرار داشتند. بین سطح متیلاسیون و مقاومت دارویی ارتباط آماری معنی داری وجود داشت (P<0.05).
نتیجه گیری:
نتایج این مطالعه نشان داد که مقاوم بودن به خط اول درمان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با سطح متیلاسیون ژن N-استیل ترانسفراز مرتبط است.
کلید واژگان: سل, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, متیلاسیون, N-استیل ترانسفراز, مقاومت داروییBackground and ObjectiveThe emergence of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis and especially drug resistant strains has created problems for the treatment of tuberculosis control, worldwide. This study was performed to evaluate the changes in N-acetyltransferase (NAT) pattern of methylsonone in patients who did not respond to first-line treatment for Mycobacterium tuberculosis.
MethodsThis descriptive-analytical study was performed on 200 patients with tuberculosis. After preparing the blood sample, saturated salt method was used to extract DNA. For the determination of quantity and quality of DNA, two methods of spectrophotometry and electrophoresis on agarose gel were used. The methylation pattern of NAT1 gene was investigated by HRM method.
Results34 patients were resistant to the first line of treatment. 18 patients showed hypermethylation pattern, 12 patients showed non-methylated pattern and 4 patients showed hypomethylated pattern. 166 patients were not resistant to the first line, of which 23 patients in hypermethylated group, 120 patients in group Non-methylated and 23 patients were in the hypomethylated row. There was a statistically significant relationship between methylation level and drug resistance (P<0.05).
ConclusionThis study showed that resistance to first-line treatment of Mycobacterium tuberculosis was related to the level of N-acetyltransferase gene methylation.
Keywords: Tuberculosis, Mycobacterium Tuberculosis, Methylation, N-acetyltransferase, Drug Resistance -
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سال بیست و پنجم شماره 5 (پیاپی 109، آذر و دی 1399)، صص 141 -146زمینه و هدف
پنومونی نکروزان یکی از بیماری های ناشایع ریوی است که درصد مرگ ومیر بالایی دارد، عوامل مختلی می تواند در بروز این بیماری دخیل باشند.
موردبیمار آقای 78 ساله با سرفه و تنگی نفس که طی بررسی های انجام شده توسط تصویربرداری Xray و سی تی اسکن و برونکوسکوپی از ریه بیمار نمونه گرفته شد . در بررسی صورت گرفته از لاواژ توسط تست اسید فست از نظر مایکوباکتریوم توبرکلیزیس مثبت بود
نتیجه گیریکیس پیش رو یکی از ناشایع ترین تظاهرات بیماری مایکوباکتریوم توبرکوزیس است که نیاز مبرم به بررسی بیماری مایکوباکتریوم توبرکلوزیس را در بیماران مزمن تنفسی و بیماران تنفسی مقاوم به درمان بیان می دارد.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, COPD, پنومونی نکروزانScientific Journal of Kurdistan University of Medical Sciences, Volume:25 Issue: 5, 2020, PP 141 -146Background and AimNecrotizing pneumonia is an uncommon disorder with a high mortality rate. Different factors are involved in the incidence of this disease.
CaseA 73 years old man was admitted to the hospital with a chief complaint of dyspnea and productive cough. Chest x-ray showed a consolidation in the lower lobe of the left lung and a CT-scan revealed a cavity in the lingula. Bronchoscopy was performed and examination of bronchoalveolar lavage (BAL) fluid was positive for acid-fast bacilli. Anti-tuberculosis drugs were started for the patient.
ConclusionOur case demonstrates a rare manifestation of tuberculosis associated with lung necrosis and cavitation, which emphasizes the necessity of examination and work-ups for mycobacterium TB in patients with drug resistant chronic pulmonary disease.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, COPD, Necrotizing Pneumonia -
بیماری سل یکی از خطرناک ترین بیماری های عفونی در جهان بوده و سالانه منجر به مرگ نزدیک به دو میلیون نفر، به ویژه در کشورهای در حال توسعه می شود. در این میان، سل مقاوم به درمان]Multidrug resistance tuberculosis (MDR-TB)[به علت مقاومت سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به دو داروی موثر خط اول درمان سل یعنی ایزونیازید و ریفامپین است که در سطح جهان رو به افزایش است. سویه های MDR-TB عمدتا در نتیجه درمان نامناسب و ناکافی بیماران مبتلا به سل پدید آمده اند. ظهور و گسترش این سویه ها مانعی برای کنترل و مدیریت بیماری سل و همچنین تهدیدی برای هدف سازمان بهداشت جهانی مبنی بر حذف این بیماری تا سال 2050 است. مدیریت صحیح MDR-TB بر شناخت زودهنگام این بیماری متکی است. اخیرا روش های تشخیصی فنوتیپی و ژنوتیپی برای شناسایی سریع این سویه ها در بیماران مشکوک به سل ایجاد شده است که برخی از آنها از نظر اقتصادی برای استفاده در کشورهای در حال توسعه نیز مناسب هستند. درمان صحیح بیماران مبتلا به سل مقاوم به دارو در نتیجه شناسایی و تشخیص سریع سویه های مقاوم به درمان و تجویز داروی مناسب است. نظارت منظم بر وضعیت بیماران نسبت به عوارض جانبی داروها و همچنین افزایش کیفیت روش های باکتریایی برای شناسایی سویه های مقاوم امری ضروری است. بنابراین در این مطالعه، مکانیسم های عملکرد و همچنین مزایا و محدودیت های ابزارها و روش های تشخیص حساسیت دارویی سل به منظور شناسایی سریع و دقیق مقاومت های دارویی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بررسی شد.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, مقاومت دارویی, MDR-TB, روش حساسیت داروییTuberculosis is one of the most dangerous infectious diseases in the world and causes nearly two million deaths each year, especially in developing countries. Meanwhile, multidrug resistance tuberculosis (MDR-TB) is due to the resistance of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) strains to two effective first-line drugs, isoniazid and rifampin, which is increasing worldwide. MDR-TB strains are mainly caused by inadequate treatment of TB patients. The emergence and spread of these strains is an obstacle to the control and management of tuberculosis as well as a threat to the World Health Organization's goal of eliminating the disease by 2050. Proper management of MDR-TB relies on early recognition of the disease. Recently, phenotypic and genotypic diagnostic methods have been developed to rapidly identify MDR strains in tuberculosis patients. Some of them are also economically suitable to use in developing countries. Proper treatment of patients with drug-resistant TB requires the rapid detection of resistant strains and appropriate drug administration. Regular monitoring of patients' side effects of medications as well as enhancing the quality of bacterial tests is essential to identify resistant strains. Therefore, in this review, we will describe the available phenotypic and genotypic tests for drug-resistant tuberculosis detection and discuss their advantages and limitations.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, Drug resistance, MDR-TB, Drug susceptibility test -
زمینه
توبرکلوزیس (TB) با بیش از 10 میلیون مورد جدید در سال و به عنوان یکی از 10 عامل مرگ ومیر مطرح در دنیا، همچنان یکی از مهم ترین مشکلات بهداشت جهانی است. همچنین سل مقاوم به درمان چند دارویی (MDR)، خطر جدی برای سلامت عمومی است. درک الگوی اپیدمیولوژیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (MTB)، که موجب برآاورد انتقال اخیر و عود عفونت TB می باشد، با روش های تیپ بندی ملکولی امکان پذیر می باشد. این مطالعه با هدف مسیریابی و تعیین نوع انتقال عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس همراه با عوامل دموگرافیکی با روش PGRS_RFLP انجام شد.
مواد و روش هادر این مطالعه 90 نمونه جمع آوری شده از بیماران مبتلا به سل ریوی از استان های شمال غرب و غرب ایران، با تشخیص فراوانی توالی های غنی از GC تیپ بندی گردید و عوامل دموگرافیکی مرتبط با انواع انتقال بیماری بررسی شد.
یافته هاتمام جدایه های تحت مطالعه به44 خوشه تقسیم شدند، که 28 تیپ آن (3/33 درصد) منحصر به فرد بوده و 16 تیپ در خوشه های چند عضوی قرار گرفتند. و بزرگ ترین خوشه، خوشه 8 عضوی (52/9 درصد)، مربوط به استان های غرب ایران بود.
نتیجه گیریتنوع ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس دراین منطقه بسیار بالاست. میزان انتقال اخیر بر اساس خوشه بندی دور از انتظار بود (متوسط جهانی 40-30 درصد). انتقال اخیر بیماری در منطقه غرب ایران در مقایسه با منطقه شمال غرب بسیار پویاتر بود. خوشه بندی بر اساس PGRS_RFLP، همبستگی بالای اطلاعات ملکولی و کلاسیک را نشان می دهد. همچنین وجود رابطه معنی دار بین سابقه واکسیناسیون و خوشه بندی لزوم انجام مطالعات گسترده را نشان می دهد.
کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, PGRS-RFLP, تیپ بندی ملکولی, اپیدمیولوژیBackgroundTuberculosis (TB) with more than 10 million new cases per year and one of the top 10 causes of death worldwide, is still one of the most important global health problems. Also, multi drug-resistant tuberculosis (MDR) is a serious danger to public health. Understanding of the epidemiological pattern of mycobacterium tuberculosis (MTB), Estimates of recent transmission and recurrence of infection, it is possible with molecular typing methods. The present study was performed aiming to track and determine the type of Mycobacterium tuberculosis infection, as well as its relationship with demographic factors, using PGRS-RFLP.
Materials and MethodsIn this study, 90 samples collected from TB patients from the North West provinces of Iran, Molecular typing by Characterization highly abundant polymorphic GC-rich-repetitive sequence. Investigated Demographic factors associated with the transmission of the disease.
ResultsAll isolates were grouped into 44 clusters 28types (33.3%) of the subspecies were in unique stains and 66.7% (from 56 patients) had clustered isolates. The largest cluster contained 8 isolates (9.52%) was the West provinces of Iran.
ConclusionGenetic variation of Mycobacterium tuberculosis is high in this region. The rate of recent transmission based on clustering was unexpected (The global average is 30%-40%). The recent transmission was more dynamic in the west than northwest Iran. Clustering based on PGRS-RFLP can demonstrate the high correlation between molecular and classic information. In addition, the significant relationship between vaccination record and clustering highlights the necessity to conduct more extensive studies.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, PGRS-RFLP, Molecular typing, Epidemiology
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.